Основна задача відділу виконання Плану протиепізоотичних заходів з
профілактики інфекційних і паразитарних захворювань тварин в Україні, а також моніторинг основних інфекційних захворювань.
В разі підозри на захворювання матеріал від тварин досліджується
методом полімеразної ланцюгової реакції в реальному часі (ПЛР-РЧ), та серологічними методами для встановлення діагнозу.